Apparues dans les versions X/Y sur Nintendo 3DS, elles font parties des fonctionnalités proposées dans la quasi-totalité des jeux jusqu’à maintenant.
Le processus de cette puissante transformation temporaire est simple : le dresseur doit posséder une Gemme Sésame et le Pokémon doit tenir une Méga-Gemme qui lui est dédié. Si ces deux conditions sont réunies, la Méga-Evolution peut être activée à tout moment dans un combat.

Gemme Sésame et Méga-Gemme
Pokémon Let’s Go Pikachu/Evoli n’échappe pas à la règle et vu que seuls 153 Pokémon sont présents (dont les 151 de la région de Kanto), voici la liste des espèces qui sont compatibles :
| Pokémon pouvant méga-évoluer | Méga-Evolution | Méga-Gemme nécessaire | Moyen d’obtention |
| Florizarre | Méga-Florizarre | Florizarrite | Offert par Blue durant l’aventure |
| Dracaufeu | Méga-Dracaufeu X Méga-Dracaufeu Y |
Dracaufite X Dracaufite Y |
Offertes par Blue durant l’aventure |
| Tortank | Méga-Tortank | Tortankite | Offerte par Blue durant l’aventure |
| Dardargnan | Méga-Dardargnan | Dardargnite | Achat à la Ligue Pokémon via un PNJ (post-ligue) |
| Roucarnage | Méga-Roucarnage | Roucarnagite | Achat à la Ligue Pokémon via un PNJ (post-ligue) |
| Alakazam | Méga-Alakazam | Alakazamite | Achat à la Ligue Pokémon via un PNJ (post-ligue) |
| Flagadoss | Méga-Flagadoss | Flagadossite | Achat à la Ligue Pokémon via un PNJ (post-ligue) |
| Ectoplasma | Méga-Ectoplasma | Ectoplasmite | Achat à la Ligue Pokémon via un PNJ (post-ligue) |
| Kangourex | Méga-Kangourex | Kangourexite | Achat à la Ligue Pokémon via un PNJ (post-ligue) |
| Scarabrute | Méga-Scarabrute | Scarabruite | Achat à la Ligue Pokémon via un PNJ (post-ligue) |
| Léviator | Méga-Léviator | Léviatorite | Achat à la Ligue Pokémon via un PNJ (post-ligue) |
| Ptéra | Méga-Ptéra | Ptéraïte | Achat à la Ligue Pokémon via un PNJ (post-ligue) |
| Mewtwo | Méga-Mewtwo X Méga-Mewtwo Y |
Mewtwoïte X Mewtwoïte Y |
Offertes par Green après l’avoir affrontée dans la Caverne Azurée une fois Mewtwo capturé (post-ligue) |



