On y incarne une héroïne qui doit réunir des objets spécifiques afin de vaincre un fléau. Divers monstres de difficulté croissante ainsi que plusieurs zones de jeu sont présents.
Deux ans après les évènements de Bravely Default, on incarne Yew Généolgia dans une aventure mêlant combats et magie avec pour objectif de sauver la papesse Agnès.
Suite de Fate Extra, l'intrigue du jeu est centré sur le conflit entre trois factions et la tentative de résolution de celui-ci par Saber.
Avec quatorze personnages jouables, vous aurez pour mission de défendre des cristaux spéciaux face à l'empire de Milites qui a déclaré la guerre au sein du monde d'Orience.