Créez vos propres Skylanders (ou utilisez ceux qui existent déjà) pour combattre Kaos et ses sbires dans cette aventure ultime aux côtés des tout-puissants Sensei pour sauver les Skylands.
Inspiré des films Alien et Predator, le joueur incarne un Predator qui a pour but d'éliminer tous les Alien de la planète Vega 4.